（Primer Premier V6V1.0.0）Primer Premier V6下载【非官方版】

发布时间：2023-08-29 6:35:43 浏览：4 分类：休闲游戏

Primer Premier是一款高度专业的PCR引物设计软件。 Primer Premier软件分为序列编辑窗口（Genetank）、引物设计窗口（PrimerDesign）、限制性分析窗口（RestrictionSites）和质构分析窗口（Motif）四个模块，可为PCR反应提供专业的引物设计功能。

Primer Premier软件特色

1.主界面可分为序列编辑窗口（Genetank）、引物设计窗口（Primer Design）、限制性分析窗口（Restriction Sites）和模式碱基分析窗口（Motif）四大块

2.本软件用于引物设计

3.只需手动拖动鼠标即可扩增相应片段所需的引物

4、手册中任意一点，各种参数变化以及可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等都显示在下面。还可以给定条件让软件自动搜索引物并显示引物分析结果

5.执行这些操作非常简单

Primer Premier软件功能

CR 引物设计- 设计用于PCR 和多重实验的引物对。

跨物种- 扩增多个物种的序列。

致病性测定- 在高度保守的地理区域中绘制寡核苷酸图谱。

等位基因特异性- 仅扩增一组相关序列中的一个成员。

简并性- 从氨基酸序列开始，反向翻译并自动设计低简并性区域的寡核苷酸。

嵌套/多个- 检查多个候选寡核苷酸之间的同源性。

限制性酶和基序分析- 从数据库中的800 多种酶和200 种常见基序中进行选择。

Clustal W 比对- 使用任何资源（包括EBI）执行ClustalW 比对后加载比对序列。

多序列比对- 使用流行的Clustal W 算法在桌面上比对序列（仅限Windows 版本）。

算法- 使用Breslauer 值计算Tm。

长PCR - 处理高达50 KB 的序列。

Primer Premier使用技巧

主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析和基序搜索的功能相对简单。点击功能按钮后，选择相应的限制性内切酶或基序（如-10序列、-35序列等），然后按“确定”。常见的限制性内切酶和基序通常是可用的。您还可以编辑或添加新的限制性酶或基序。

设计引物时，打开DNA序列，点击引物按钮，会出现“搜索条件”窗口，里面有各种参数可以调整。搜索目的有3个选项（SeachFor），PCR引物（PCPRrimers）、测序引物（SequencingPrimers）和杂交探针（HybridizationProbes）。搜索类型（SearchType）可以选择单独或同时搜索上下游引物（Sense/Anti-sensePrimer，或Both），或成对搜索（Pairs），或使用合适的上下游引物（CompatiblewithSense/Anti-sensePrimer ）。此外，还可以更改选择区域（SearchRanges）、引物长度（PrimerLength）、选择方法（SearchMode）、参数选择（SearchParameters）等。用户可以根据自己的需要设置各种参数。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。然后按搜索，当出现的SearchProgress窗口中显示SearchCompleted时，按确定，搜索结果就会以表格的形式出现。显示方式有上游引物（Sense）、下游引物（Anti-sense）、配对显示（Pairs）三种。默认情况下，它显示为一对，并按优缺点（评级）顺序排列。满分为100分，表示各项指标基本达到标准。

单击一对引物，例如引物#1，然后移动或退出上述窗口，显示“PeimerPremier”的主窗口。结果分为三部分，上面是PCR模板和产物位置，中间是所选的上下游引物的一些性质，下面是四个重要指标的分析，包括发夹结构（Hairpin）、二聚体（Dimer）、假引发（FalsePriming）以及上游和下游引物之间形成二聚体（Cross Dimer）。当分析的引物有可能形成这四种结构时，按钮将从变为。点击该按钮，左下角窗口中会出现结构的形成。理想的一对引物不应具有上述任何结构，因此最好的情况是底部分析柱没有，只有。值得注意的是，中柱末尾给出了引物的最佳退火温度，可以参考应用。

当引物需要修改和编辑时，例如在5\'端添加限制性位点，点击，然后修改引物序列。要返回搜索结果，请单击按钮。如果要设计简并引物，只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述八种遗传密码规则，反演为DNA序列即可。简并引物的分析不需要像一般引物那样严格。总之，“Premier”具有优秀的自动引物搜索功能，并且可以同时分析一些指标，并且易于使用。这是一个非常好的软件。