(Primer Premier V6V1.3)Primer Premier V6下载【无限版 】
Primer Premier是基因工程中常用的引物设计软件。我们可以使用Primer Premier来完成引物设计、序列编辑、限制性分析等各种操作,而且这款Primer Premier软件还可以帮助用户快速分析各种数据,以获得最准确的结论数据。
Primer Premier软件特色
Primer Premier软件还可以将DNA和氨基酸序列转换为模板DNA来源的相应遗传密码规则。软件提供了总共八种不同遗传密码规则的生物亚结构供用户选择,包括纤毛虫大核、无脊椎动物线粒体、支原体、植物线粒体、原生动物线粒体(原生动物线粒体)、通用标准(Standard)、脊椎动物线粒体和酵母线粒体。 Primer Premier软件具有优秀的自动引物搜索功能,并且可以同时分析一些指标,使用方便。被引物设计界认为是一款非常优秀的软件。
Primer Premier功能介绍
1.主界面可分为序列编辑窗口(Genetank)、引物设计窗口(Primer Design)、限制性分析窗口(Restriction Sites)和模式碱基分析窗口(Motif)四大块
2.本软件用于引物设计
3.只需手动拖动鼠标即可扩增相应片段所需的引物
4、手册中任意一点,各种参数变化以及可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等都显示在下面。还可以给定条件让软件自动搜索引物并显示引物分析结果
5.执行这些操作非常简单
Primer Premier安装方法
1、下载解压后,双击PP600Installer.exe启动安装包,然后勾选协议协议,点击下一步
2.只需单击“下一步”
3.选择安装位置,点击安装
4.等待安装完成
5.安装完成后,点击Done结束安装
Primer Premier使用技巧
1. 限制性酶切点分析和基序搜索功能
1、主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析和基序搜索的功能相对简单。点击功能按钮后,选择相应的限制性内切酶或基序(如-10序列、-35序列等),然后按OK
2. 常见的限制性内切酶和基序一般都能找到,也可以编辑或添加新的限制性内切酶或基序
2. 引物设计
1.打开DNA序列后,点击引物按钮,会出现“搜索条件”窗口,里面有各种参数可以调整
2. 搜索目的(Seach For)共有三个选项,PCR引物(PCR Primers)、测序引物(Sequencing Primers)和杂交探针(Hybridization Probes)
3. 搜索类型(Search Type)可以选择单独或同时搜索上下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或成对搜索(Pairs),或使用合适的上下游引物(Compatible with有义/反义引物)。此外,还可以更改选择区域(Search Ranges)、引物长度(Primer Length)、选择方法(Search Mode)、参数选择(SearchParameters)等。
3、用户可根据需要设置各种参数。如果没有特殊要求,建议使用默认设置。然后按“搜索”,当出现的搜索进度窗口中显示“搜索完成”时,再次按“确定”,搜索结果将以表格的形式出现。有三种显示方式,上游引物(Sense)、下游引物(Anti-sense)、成对显示(Pairs)。默认成对显示,并按优劣顺序排列(Rating),满分100分,即各项指标基本都能达标
3. 底漆点击
1. 单击一对引物,例如引物#1,然后移动或退出上述窗口,显示“Peimer Premier”的主窗口。结果分为三个部分,
2.模板和产物的位置,中间是所选上下游引物的一些性质,最下面是四个重要指标的分析,包括发夹结构(Hairpin)、二聚体(Dimer)、假引发(假引发),以及上游和下游引物之间形成二聚体(交叉二聚体)
3、当分析的引物有形成这四种结构的可能性时,按钮由变为,点击该按钮,左下角窗口中会出现该结构的形成
4、理想的一对引物不应该有上述任何一种结构,所以最好的情况是底部分析柱没有,只有。值得注意的是,中间一栏的末尾给出了引物的最佳退火温度
4. 引物修饰编辑
1. 当引物需要修改编辑时,如在5\'端添加限制性位点,点击,然后修改引物序列
2. 要返回搜索结果,请单击按钮。如果要设计简并引物,只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述八种遗传密码规则,反演为DNA序列即可。 3、简并引物的分析不需要像一般引物那样严格
4、总之,“Premier”具有优秀的引物自动搜索功能,并且可以同时分析一些指标,使用方便。这是一个非常好的软件
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